中心教学团队现有固定人员57人，根据教学内容组建了8个课程教学团队，分别为“环境监测”、“环境工程微生物学”、“校园环境质量监测”、“环境工程原理”、“水处理工程”、“大气污染控制工程”、“固体废物处理处置工程”、“土壤与地下水污染防治工程”课程教学团队。

中心的实验教学和理论教学队伍密切配合。课程教学团队由理论课程主讲教师、实习指导教师、实验指导教师、具有丰富工程经验的企业专家以及博士生助教等共同组成，实现了队伍互通，校内外师资流动，教学、科研、技术兼容。

中心教学团队成员40岁以下5人、40-49岁22人、50-59岁18人、60岁以上12人，正高、副高、中级的比例约为15:10:1，博士占比91%、硕士占比9%，包括中国工程院院士4人、国家级教学名师3人、北京市教学名师4人，是一支老中青结合、结构合理、梯级衔接的稳定、精干、可持续的教学与管理队伍。此外，中心每年聘任10余名在读博士生担任助教，配合实验教学工作。